
Profesor Ordinario de Carrera Titular C de Tiempo Completo
- Grupo de Investigación en Biotecnología y Biociencias
- Cuerpo Académico Biológico-Farmacéutico
- Investigador Nacional Nivel 2
- PTC con Perfil Deseable
1986–1990 | Químico Farmacobiólogo (FCQ, UABC)
1991–1993 | Especialista en Docencia (DAA, UABC)
1994–2001 | Doctor en Ciencias Bioquímicas (IBt, UNAM)
2006–2007 | Profesor visitante (Escuela de Medicina, UCSD)
Correo-e | mramos@uabc.edu.mx
Identificadores | ORCID: 0000-0002-8950-2079 | Scopus: 7203081962 | ResearcherID: D-5438-2012
Perfiles | ResearchGate | Google Scholar | Semantic Scholar | Loop Profile
Páginas | GIBB | GIBB Informa
Profesor e investigador con más de 35 años de experiencia académica y científica. Es integrante del Sistema Nacional de Investigadores desde 1997, actualmente vigente como Investigador Nacional Nivel 2 del SNII/SECIHTI (2026–2030), y forma parte del Programa para el Desarrollo Profesional Docente desde 2002, vigente como PTC con Perfil Deseable del PRODEP/SEP (2025–2028). A la fecha, ha participado en la publicación de 47 artículos científicos y 4 capítulos de libro, y ha fungido como director o codirector de más de 35 tesis de investigación.
Desarrolla una línea de investigación orientada a comprender los aspectos moleculares, bioquímicos, biofísicos y celulares del plegamiento oxidativo de proteínas, con énfasis en el papel funcional de las disulfuro oxidorreductasas, a través de modelos de estudio in vivo, in vitro e in silico.
Su interés se centra en la generación y aplicación de conocimiento de frontera para la caracterización de procesos moleculares y bioquímicos específicos de patógenos humanos causantes de enfermedades tropicales desatendidas.
Publicaciones recientes (2020-2026)
Frayde-Gómez H, Chimal-Vega B, Pulido Capiz A, Muñoz-Ayala A, Galindo-Hernández O, Víque-Sánchez JL, Leija-Montoya AG, Díaz-Molina R, Madero-Ayala PA, Ramos-Ibarra MA, García-González V. The translation factor eIF4E is a key mediator of doxorubicin resistance: Insights from a triple-negative breast cancer model. Scientific Reports. 2026. DOI: 10.1038/s41598-025-31313-6. PMID: 41501122.
Pérez-Zamora A, Rivero IA, Ávila-Cossío ME, Muñoz-Muñoz PLA, Mares-Alejandre RE, Ramos-Ibarra MA, Espinoza KA. Preparation of PVDMA/PEI polymeric films functionalized with amino acids and their study on adhesion and proliferation of Escherichia coli. Journal of the Brazilian Chemical Society. 2026. DOI: 10.21577/0103-5053.20250187.
Madero-Ayala PA, Mares-Alejandre RE, Muñoz-Muñoz PLA, Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Structure-Based Insights into Stefin-Mediated Targeting of Fowlerpain-1: Towards Novel Therapeutics for Naegleria fowleri Infections. Pharmaceuticals. 2025; 18(11): 1606. DOI: 10.3390/ph18111606. PMID: 41304853.
Muñoz-Muñoz PLA, Terán-Ramírez C, Mares-Alejandre RE, Márquez-González AB, Madero-Ayala PA, Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Surface Engineering of Escherichia coli to Display Its Phytase (AppA) and Functional Analysis of Enzyme Activities. Curr Issues Mol Biol. 2024; 46(4): 3424-3437. DOI: 10.3390/cimb46040215. PMID: 38666945.
Muñoz-Muñoz PLA, Mares-Alejandre RE, Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Structural Insights into the Giardia lamblia Target of Rapamycin Homolog: A Bioinformatics Approach. Int J Mol Sci. 2023; 24(15): 11992. DOI: 10.3390/ijms241511992. PMID: 37569368.
Madero-Ayala PA, Mares-Alejandre RE, Ramos-Ibarra MA. In Silico Structural Analysis of Serine Carboxypeptidase Nf314, a Potential Drug Target in Naegleria fowleri Infections. Int J Mol Sci. 2022; 23(20): 12203. DOI: 10.3390/ijms232012203. PMID: 36293059.
Muñoz-Muñoz PLA, Mares-Alejandre RE, Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. Bioinformatic Analysis of Two TOR (Target of Rapamycin)-Like Proteins Encoded by Entamoeba histolytica Revealed Structural Similarities with Functional Homologs. Genes. 2021; 12(8): 1139. DOI: 10.3390/genes12081139. PMID: 34440318.
Rodríguez-García Á, Mares-Alejandre RE, Muñoz-Muñoz PLA, Ruvalcaba-Ruiz S, González-Sánchez RA, Bernáldez-Sarabia J, Meléndez-López SG, Licea-Navarro AF, Ramos-Ibarra MA. Molecular Analysis of Streptomycin Resistance Genes in Clinical Strains of Mycobacterium tuberculosis and Biocomputational Analysis of the MtGidB L101F Variant. Antibiotics. 2021; 10(7): 807. DOI: 10.3390/antibiotics10070807. PMID: 34356728.
Terán-Ramírez C, Mares-Alejandre RE, Estrada-González AL, Muñoz-Muñoz PLA, Ramos-Ibarra MA. Structure-Function Relationship Study of a Secretory Amoebic Phosphatase: A Computational-Experimental Approach. Int J Mol Sci. 2021; 22(4): 2164. DOI: 10.3390/ijms22042164. PMID: 33671604.
Madero-Ayala PA, Mares-Alejandre RE, Ramos-Ibarra MA. A Molecular Dynamics Approach on the Y393C Variant of Protein Disulfide Isomerase A1. Chem Biol Drug Des. 2020; 96(6): 1341-1347. DOI: 10.1111/cbdd.13700. PMID: 32352225.
Martínez-Navarro I, Díaz-Molina R, Pulido-Capiz A, Mas-Oliva J, Luna-Reyes I, Rodríguez-Velázquez E, Rivero IA, Ramos-Ibarra MA, Alatorre-Meda M, García-González V. Lipid Modulation in the Formation of β-Sheet Structures. Implications for De Novo Design of Human Islet Amyloid Polypeptide and the Impact on β-Cell Homeostasis. Biomolecules. 2020; 10(9): 1201. DOI: 10.3390/biom10091201. PMID: 32824918.
Torres-Bañaga R, Mares-Alejandre RE, Terán-Ramírez C, Estrada-González AL, Muñoz-Muñoz PLA, Meléndez-López SG, Rivero IA, Ramos-Ibarra MA. Functional Display of an Amoebic Chitinase in Escherichia coli Expressing the Catalytic Domain of EhCHT1 on the Bacterial Cell Surface. Appl Biochem Biotechnol. 2020; 192(4): 1255-1269. DOI: 10.1007/s12010-020-03389-5. PMID: 32715415.
Depósitos en bases de datos y repositorios
GenBank
Salgado M, Villagómez-Castro JC, Rocha-Rodríguez R, Sabanero-López M, Ramos MA, Alagón A, López-Romero E, Sánchez-López R. Entamoeba histolytica Sec61 alpha subunit gene, complete cds. National Center for Biotechnology Information. 2005. GenBank: AY730760.1. PMID: 15913610.
Ramos MA, Sánchez-López R, Mares RE, Olvera F, Alagón A. Entamoeba histolytica protein disulfide isomerase (PDI) mRNA, complete cds. National Center for Biotechnology Information. 2005. GenBank: AY730725.2. PMID: 15990181.
Ramos MA, Stock RP, Sánchez-López R, Olvera F, Lizardi PM, Alagón A. Entamoeba histolytica proteasome alpha subunit gene. National Center for Biotechnology Information. 2002. GenBank: AF386797.1. PMID: 9041528.
Ramos MA, Mercado GC, Salgado LM, Sánchez-López R, Stock RP, Lizardi PM, Alagón A. Entamoeba histolytica signal recognition particle 54 kDa subunit (SRP54) gene. National Center for Biotechnology Information. 2002. GenBank: AF386797.1. PMID: 9274882.
Ramos MA, Sánchez-López R, Olvera F, Alagón A. Entamoeba histolytica serine-threonine protein kinase YAK1 and serine-threonine protein kinase PK2 genes. National Center for Biotechnology Information. 2002. GenBank: AF386797.1. PMID: 12054704.
Juárez P, Sánchez-López R, Stock RP, Olvera A, Ramos MA, Alagón A. Entamoeba histolytica small GTP-binding protein Rab8 (rab8) gene, partial cds. National Center for Biotechnology Information. 2001. GenBank: AF363067.1. PMID: 11522355.
Juárez P, Sánchez-López R, Stock RP, Olvera A, Ramos MA, Alagón A. Entamoeba histolytica small GTP-binding protein Rab8 (rab8) mRNA, complete cds. National Center for Biotechnology Information. 2001. GenBank: AF389109.1. PMID: 11522355.
Sánchez-López R, Gama-Castro S, Ramos MA, Merino E, Lizardi PM, Alagón A. Entamoeba histolytica ERD2 gene. National Center for Biotechnology Information. 1998. GenBank: AJ002138.1. PMID: 9657339.
GitHub
En actualización.
Zenodo
Osuna-Leal JH, Mares-Alejandre RE, Muñoz-Muñoz PLA, Meléndez-López SG, Madero-Ayala PA, Ramos-Ibarra MA. Mejora de la estabilidad térmica de la quitinasa amibiana EhCHT1c mediante ingeniería racional de enlaces disulfuro y despliegue en superficie bacteriana. 2026. DOI: 10.5281/zenodo.20587242.
Armenta-Montoya CO, Mares-Alejandre RE, Muñoz-Muñoz PLA, Meléndez-López SG, Madero-Ayala PA, Ramos-Ibarra MA. Producción recombinante de alfa-sinucleína humana e implementación de un bioensayo para determinar microagregados proteicos. 2025. DOI: 10.5281/zenodo.20127765.
ModelArchive
Madero-Ayala PA, Mares-Alejandre RE, Muñoz-Muñoz PLA, Meléndez-López SG, Ramos-Ibarra MA. 3D structural model of Fowlerpain-1, a papain-like protease from Naegleria fowleri. 2025. DOI: 10.5452/ma-8buks.
Última Actualización: 26/07/2026.
